2021-06-21 08:33:41 來源 : IT之家
“10年時間,10億美元,10%成功率。”常被用來形容新藥上市的難度和窘迫現(xiàn)狀。根據(jù)美國塔夫茨大學(xué)藥物開發(fā)研究中心(Tufts Center for the Study of Drug Development, CSDD)發(fā)布的數(shù)據(jù),截至2014年,研發(fā)一款新藥至上市的成本約為26億美元,與2003年相比,增長了145%。然而,新藥上市后的回報并不一定能完全覆蓋其研發(fā)時的成本。這樣的現(xiàn)狀迫使醫(yī)藥行業(yè)不得不尋求破局之道,而AI技術(shù)高效處理數(shù)據(jù)的能力使其成為醫(yī)藥公司嘗試的新解決辦法。
2020年年底,專注于制藥、生物技術(shù)和醫(yī)療保健技術(shù)行業(yè)的咨詢機構(gòu)Deep Pharma Intelligence(DPI)發(fā)布了《2020 年制藥行業(yè)的人工智能報告》,通過對240家使用人工智能研發(fā)新藥的公司和600位在AI生物醫(yī)藥研發(fā)領(lǐng)域投資的投資者進行分析,展現(xiàn)了目前AI在生物醫(yī)藥領(lǐng)域的發(fā)展現(xiàn)狀及挑戰(zhàn)。
01 應(yīng)用:多方向輸出
根據(jù)藥物研發(fā)過程,AI技術(shù)可用于靶點發(fā)現(xiàn)、早期藥物研發(fā)、臨床前實驗的設(shè)計與處理、臨床試驗、現(xiàn)有藥物再利用、信息整合與新見解輸出等多個方向。
AI已被一些大型制藥公司視為新的藥物研發(fā)工具。構(gòu)建模型和從非結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)中挖掘數(shù)據(jù),被認為是人工智能在藥物發(fā)現(xiàn)方面最具顛覆性的領(lǐng)域。而在靶點發(fā)現(xiàn)和早期藥物發(fā)現(xiàn)具體環(huán)節(jié),AI技術(shù)常被用于這些方面:分析數(shù)據(jù)集,形成假設(shè)并產(chǎn)生新見解;識別候選新藥;通過對比分析健康人群和患者樣本的數(shù)據(jù)來尋找新的生物標(biāo)記物和治療靶點;預(yù)測分子的親和力和其他藥理特性;降低蛋白質(zhì)設(shè)計的復(fù)雜性。
在臨床前實驗的設(shè)計與處理環(huán)節(jié),AI技術(shù)希望被用來減少實驗階段時間、降低成本和不確定性。一般情況下,AI制藥公司會通過分析已有數(shù)據(jù)來尋找新的研發(fā)角度,自動化樣品分析與機器云實驗室也隨之興起。
在臨床試驗階段,AI技術(shù)被期待的用途則更多。例如,優(yōu)化臨床試驗研究設(shè)計;將不同的生物醫(yī)學(xué)和醫(yī)療保健數(shù)據(jù)流轉(zhuǎn)換為代表個體患者的計算機模型;通過為個別患者提供最佳的健康干預(yù)措施,從而提供大規(guī)模個性化醫(yī)療;通過分析病歷,尋找合適的臨床試驗患者;通過個人病史和基因分析自動匹配癌癥患者的臨床試驗;改善病理分析。
在尋找新冠肺炎治療方案的過程中,醫(yī)藥行業(yè)看到了對現(xiàn)有藥物再利用的可行性和重要性。而AI技術(shù)也被用于對現(xiàn)有藥物再利用的挖掘,其在快速識別許多已知藥物的新適應(yīng)證、將現(xiàn)有藥物與罕見疾病匹配、通過大量生物實驗測試尋找到模型化合物等方面擁有明顯優(yōu)勢。
在以上環(huán)節(jié)AI技術(shù)或許還存在很多需要挑戰(zhàn)的地方,但在信息匯總和整合方面AI技術(shù)則比人工更勝一籌。目前,AI技術(shù)已被用于分析文獻、從數(shù)千個不相關(guān)的數(shù)據(jù)源中得出新觀點、改善決策、消除研究盲點、識別空白競爭領(lǐng)域等多個重要方面。
02 參與:多玩家入局
不論是AI技術(shù),還是AI技術(shù)在制藥領(lǐng)域的應(yīng)用,都是全球多個國家大力發(fā)展的領(lǐng)域。
從全球布局來看,美國既是AI行業(yè)的先鋒又是主要參與者,其AI技術(shù)研發(fā)公司數(shù)量位居全球首位。全球240家AI技術(shù)研發(fā)公司中有54.4%的公司位于美國。這也使得美國的藥企、研發(fā)機構(gòu)和投資機構(gòu)可接觸的AI技術(shù)研發(fā)公司最多。
中國則是亞太地區(qū)的“人工智能超級大國”,雖然全球只有8.4%的AI技術(shù)研發(fā)公司位于亞太地區(qū),但在中國的公司占了近30%。國內(nèi)政府和投資機構(gòu)也都在加大對AI行業(yè)的投入,其中北京將建設(shè)21.2億美元的AI開發(fā)項目,天津也將投資160億美元在當(dāng)?shù)氐腁I產(chǎn)業(yè)中,國內(nèi)至少有10家估值超過10億美元的AI初創(chuàng)公司。
歐洲一直是生物制藥企業(yè)無法忽視的市場,在這樣的一片土地上出現(xiàn)了多起關(guān)于AI藥物研發(fā)的交易。諾華成立了諾華人工智能創(chuàng)新實驗室,并選擇微軟公司作為其人工智能和數(shù)據(jù)科學(xué)的戰(zhàn)略合作伙伴,宣布在重塑醫(yī)藥領(lǐng)域中邁出了重要一步。葛蘭素史克宣布與Exscientia、Insilicon Medicine等公司達成協(xié)議,想要嘗試新的計算機建模系統(tǒng)。歐洲最大AI新藥研發(fā)公司BenevolentAI也受到了眾多藥企的關(guān)注與青睞,阿斯利康、強生等紛紛與其合作開發(fā)新藥。
而這一切都表明,制藥公司越來越多地轉(zhuǎn)向用AI技術(shù)來改變藥物發(fā)現(xiàn)過程。
此外,拜耳、輝瑞、阿斯利康、武田、葛蘭素史克等國際藥企對AI技術(shù)在生物醫(yī)藥領(lǐng)域運用十分看好。
拜耳可以說是其中最看好該行業(yè)發(fā)展的公司之一,其AI合作伙伴包括Cyclica、Exscientia、Genpact、Schrödinger、Sensyne等多家知名AI藥物發(fā)現(xiàn)公司。
2018年8月30日,Cyclica宣布加入拜耳的Grants4Apps計劃,將與拜耳合作以加快其差異化藥物設(shè)計(DDD)技術(shù)的部署。2020年1月,拜耳與Exscientia開始了為期三年的合作,旨在識別和優(yōu)化針對心血管和腫瘤的新先導(dǎo)化合物結(jié)構(gòu)。同月,拜耳與Schrödinger宣布了一項為期五年的技術(shù)合作,以挖掘、篩選和評估可合成的虛擬化合物。
輝瑞在AI技術(shù)領(lǐng)域的合作伙伴有Atomwise、Concerto、CytoReason、IBM、Insilicon Medicine、晶泰科技等公司。
2018年9月,輝瑞與Atomwise簽訂評估協(xié)議,Atomwise將為輝瑞尋找3種靶蛋白的潛在候選藥物。2020年1月,輝瑞與Insilicon合作,將利用Insilicon的機器學(xué)習(xí)技術(shù)和專有的Pandomics發(fā)現(xiàn)平臺,為開發(fā)潛在治療靶點尋找真實世界數(shù)據(jù)。
阿斯利康也正在借助數(shù)據(jù)和AI技術(shù)更好地識別藥物靶點、招募患者,更好地設(shè)計臨床試驗,以提高藥物研發(fā)成功率。阿斯利康在AI技術(shù)領(lǐng)域的合作伙伴有 Schrödinger、BenevolentAI、Berg、DeepMatter、Gatehouse Bio等公司。
2019年9月,阿斯利康與Schrödinger開展合作,希望用Schrödinger的計算平臺來改進化合物的設(shè)計,挖掘潛在治療藥物。同年12月,阿斯利康與Gatehouse Bio合作,利用其AI平臺探索呼吸系統(tǒng)疾病和心血管疾病的藥物新靶點。
武田作為進入全球制藥企業(yè)前十的日本公司,顯示出其對于該領(lǐng)域的投入已超于日本其他藥企。其在AI技術(shù)領(lǐng)域的合作伙伴主要有Numerate和Recursion公司。
2017年6月,武田與Numerate達成一項多年期協(xié)議,將依靠Numerate的AI驅(qū)動的平臺,針對其核心治療領(lǐng)域進行活性化合物發(fā)現(xiàn)、先導(dǎo)化合物設(shè)計和優(yōu)化、化合物ADME-T性質(zhì)建模。
葛蘭素史克是AI制藥領(lǐng)域最活躍的跨國藥企之一,也是最早創(chuàng)建內(nèi)部AI部門的公司之一。在AI技術(shù)領(lǐng)域的合作伙伴則更為廣泛,包括Cloud Pharmaceuticals、Excscientia、谷歌、Insilico Medicine等公司。
藥物設(shè)計和開發(fā)公司Cloud Pharmaceuticals專有的AI驅(qū)動流程可針對藥物靶點提供完全新穎的分子。2018年5月,葛蘭素史克與Cloud Pharmaceuticals達成合作,將用AI技術(shù)平臺來設(shè)計新型小分子藥物。同年6月,葛蘭素史克研究人員與谷歌研究人員合作,用AI技術(shù)研發(fā)新藥。
03 交易:多資金投入
近兩年,大藥企對AI技術(shù)的興趣從“值得嘗試”轉(zhuǎn)變?yōu)?ldquo;具有戰(zhàn)略重要性”,這種需求帶動了AI市場的增長,也讓投資者看到了更多機會。與2019年相比,2020年AI生物技術(shù)初創(chuàng)企業(yè)獲得的投資總額增加了約23%,近19億美元,并且超過了2015年、2016年和2017年的總和。
從投資企業(yè)數(shù)量來看,谷歌風(fēng)投公司以投資13家AI制藥公司的成績位居榜首,其投資的公司包括Alector、BlackThorn Therapeutics和ZappRx等公司。
值得一提的是,藥明康德以投資7家AI制藥公司的成績進入前十,位列第六。其投資的公司包括Engine Biosciences、Insilico Medicine、Insitro和Schrödinger等Al藥物研發(fā)領(lǐng)域領(lǐng)先公司。
從企業(yè)融資金額可以看出,該行業(yè)正在加速整合。部分人工智能初創(chuàng)公司已經(jīng)取得了領(lǐng)先地位,在資源和技術(shù)方面都有所增長,而部分公司則落于人后,不得不專注于藥物研發(fā)的細分服務(wù)領(lǐng)域,也有公司已經(jīng)倒閉。
2020年9月,以數(shù)字化和智能化驅(qū)動的AI藥物研發(fā)公司晶泰科技完成3.19億美元C輪融資,創(chuàng)下當(dāng)時全球AI藥物研發(fā)領(lǐng)域最高融資額紀錄。軟銀愿景基金、紅杉中國基金、中金資本、騰訊等眾多知名投資機構(gòu)均在其投資者名單中。該公司聯(lián)合創(chuàng)始人兼董事長溫書豪是浙江大學(xué)兼職教授,他在中國科學(xué)院、美國加州大學(xué)、麻省理工學(xué)院有11年的學(xué)習(xí)、研究和工作經(jīng)驗。晶泰科技創(chuàng)立于麻省理工學(xué)院(MIT)校園,總部位于深圳,在北京、波士頓設(shè)有分部。該公司擁有包括晶型預(yù)測,單晶結(jié)構(gòu)解析,鹽、共晶虛擬篩選等多項計算類小分子藥物固態(tài)研發(fā)技術(shù),以及固態(tài)研發(fā)實驗平臺,目前已與輝瑞、華東醫(yī)藥、新格元等國內(nèi)外70多家醫(yī)藥公司達成合作,提供藥物研發(fā)服務(wù)。
同月,美國AI藥物研發(fā)公司Recursion Pharmaceuticals獲得2.39億美元D輪融資,由拜耳領(lǐng)投。此次融資額位居2020年前五大融資金額中的第二位。Recursion成立于2013年,是一家希望通過整合生物學(xué)、化學(xué)、自動化、數(shù)據(jù)科學(xué)和工程領(lǐng)域的技術(shù)創(chuàng)新來實現(xiàn)藥物發(fā)現(xiàn)產(chǎn)業(yè)化的公司。該公司科學(xué)指導(dǎo)之一的Yoshua Bengio博士曾是麻省理工學(xué)院和AT&T貝爾實驗室的博士后研究員。他與英國計算機心理學(xué)家Geoffrey Hinton,F(xiàn)acebook人工智能實驗室負責(zé)人Yann LeCun被譽為“深度學(xué)習(xí)領(lǐng)域三巨頭”。今年4月,該公司登陸納斯達克,募集資金5.02億美元。
2020年5月,Insitro完成了1.43億美元B輪融資,位居2020年前五大融資金額中的第三位,而這輪融資距離Insitro的成立還不到兩年。2018年,斯坦福大學(xué)著名學(xué)者Daphne Koller博士創(chuàng)建了Insitro。在擔(dān)任斯坦福大學(xué)計算機科學(xué)教授的近20年間,她在頂尖學(xué)術(shù)刊物上發(fā)表了200多篇論文,還曾獲得美國跨領(lǐng)域最高獎項之一的“麥克阿瑟天才獎”。Insitro對于AI技術(shù)在藥物研發(fā)中的運用很好地展現(xiàn)了AI技術(shù)的價值。其通過機器學(xué)習(xí)對具有深度表型特征的人群進行統(tǒng)計遺傳學(xué)分析來發(fā)現(xiàn)潛在靶點以及可能為臨床開發(fā)提供指導(dǎo)的特定患者群;通過建立基于細胞的預(yù)測性疾病模型,來發(fā)現(xiàn)新靶點、患者亞群和藥物,從而治療肝臟和中樞神經(jīng)系統(tǒng)疾病;利用機器學(xué)習(xí)對療法進行設(shè)計。今年3月,該公司又完成了一筆4億美元的融資,超過晶泰此前獲得的3.19億美元融資。
2020年8月,AI小分子發(fā)現(xiàn)的領(lǐng)軍企業(yè)Atomwise獲得1.23億美元B輪融資。此輪融資由B Capital Group和沙特公共投資基金Sanabil Investments領(lǐng)投,老股東DCVC、BV百度風(fēng)投、騰訊、Y Combinator等繼續(xù)追加投資。自2012年成立以來,Atomwise一直專注于開發(fā)和改進基于AI的藥物發(fā)現(xiàn)技術(shù),并創(chuàng)建了首個用于藥物發(fā)現(xiàn)的卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(CNN)。該公司已與禮來公司、拜耳、豪森等大藥企和許多新興生物技術(shù)公司達成了藥物研發(fā)合作。
2020年5月,AbCellera完成了1.05億美元的B輪融資,Data Collective Bio和Viking Global Investors等投資公司參與了本輪融資。AbCellera公司是一家AI驅(qū)動的抗體發(fā)現(xiàn)公司,其技術(shù)平臺通過匯集高通量微流控技術(shù)、機器視覺和人工智能技術(shù),能夠在單細胞水平對B細胞進行篩選,從而提高發(fā)現(xiàn)抗體候選療法的速度和效率。它與禮來公司聯(lián)合開發(fā)的候選抗體療法LY-CoV555是首批進入臨床試驗的新冠病毒中和抗體療法之一。2020年年底,該公司登陸納斯達克籌集了5.56億美元。
04 挑戰(zhàn):人才與數(shù)據(jù)
雖然AI技術(shù)在生物制藥領(lǐng)域的應(yīng)用取得了很大的進步也展現(xiàn)出很多潛力,但同樣面臨著很多挑戰(zhàn)。
一是缺乏人才。AI技術(shù)人才短缺仍是全球生物制藥行業(yè)面臨的一個嚴峻挑戰(zhàn)。雖然很多國際藥企投入大量資金招聘人工智能專家,但其大多數(shù)仍是被大型科技公司如谷歌、亞馬遜、阿里巴巴、騰訊、百度等吸納。從全球人才流向看,大多數(shù)AI技術(shù)人才仍匯集在美國。斯坦福大學(xué)人工智能研究所發(fā)布的《人工智能指數(shù)2021年年度報告》顯示,2019年北美人工智能專業(yè)畢業(yè)的博士中有65%進入產(chǎn)業(yè)界,其中有64.3%的人是國際學(xué)生。而國際學(xué)生中有81.8%的人選擇了留在美國工作。
二是缺乏可用的高質(zhì)量數(shù)據(jù),這仍是AI技術(shù)需要邁過的一道坎。深度學(xué)習(xí)模型被認為是AI技術(shù)在生物制藥領(lǐng)域最有前景的應(yīng)用,但深度學(xué)習(xí)的基礎(chǔ)是大量可用且高質(zhì)量的數(shù)據(jù)。目前來看,公共數(shù)據(jù)庫內(nèi)的數(shù)據(jù)并不能很好地實現(xiàn)建模,而高質(zhì)量的數(shù)據(jù)很少且難獲取。
三是缺乏倫理共識和完善的監(jiān)管規(guī)定。目前AI技術(shù)在倫理和監(jiān)管方面仍缺乏基準(zhǔn)和共識,在制藥行業(yè)的應(yīng)用亦是如此。雖然一些組織在AI技術(shù)倫理方面制定了一系列規(guī)定,但仍然缺乏普遍可用的衡量或評估基準(zhǔn)。此外,在AI技術(shù)產(chǎn)生的結(jié)果專利及監(jiān)管等方面,仍然缺乏相應(yīng)的法律規(guī)定。