在一項(xiàng)新的研究中，來(lái)自美國(guó)斯坦福大學(xué)等研究機(jī)構(gòu)的研究人員對(duì)坦桑尼亞哈扎族狩獵采集者（Hadza hunter-gatherer）的351份糞便樣本進(jìn)行了超深的宏基因組測(cè)序。他們?cè)敿?xì)介紹了他們對(duì)來(lái)自哈扎族狩獵采集者的最廣泛的腸道微生物組測(cè)序數(shù)據(jù)的收集和鑒定。相關(guān)研究結(jié)果于2023年6月21日在線發(fā)表在Cell期刊上，論文標(biāo)題為“Ultra-deep sequencing of Hadza hunter-gatherers recovers vanishing gut microbes”。

人體腸道微生物組的組成在世界范圍內(nèi)可能有很大的不同，這取決于當(dāng)?shù)氐娘嬍澈铜h(huán)境接觸。腸道微生物組研究嚴(yán)重偏向于腸道微生物組多樣性很低的西方工業(yè)化人群。多樣性低被認(rèn)為是由攝入高度加工的食物、更頻繁地使用抗生素、剖腹產(chǎn)率、衛(wèi)生水平以及減少與動(dòng)物和土壤的物理接觸造成的。

(相關(guān)資料圖)

這種因果關(guān)系得到了非工業(yè)化人群的支持，包括具有極高腸道微生物組多樣性的狩獵采集者。這也可以在從非工業(yè)化地區(qū)到工業(yè)化西方地區(qū)的移民的腸道微生物組變化中觀察到，這是向較低腸道微生物組多樣性的過(guò)渡。

以前對(duì)古人類糞化石的分析表明相比于工業(yè)化地區(qū)人群的腸道微生物組，古代腸道微生物組更接近現(xiàn)代非工業(yè)化地區(qū)人群腸道微生物組的較高多樣性。

這些與人類相關(guān)的微生物品系在深層進(jìn)化的時(shí)間里在人類世代之間傳遞，并且知道腸道微生物群在人類健康中起著至關(guān)重要的作用，這表明現(xiàn)在工業(yè)化地區(qū)中的腸道微生物組缺失的方面意味著這些微生物提供的功能的喪失。

圖片來(lái)自Cell, 2023, doi:10.1016/j.cell.2023.05.046。

在這項(xiàng)新的研究中，哈扎族人生活在坦桑尼亞裂谷中部的營(yíng)地，每個(gè)營(yíng)地大約有5到30人。哈扎族人大約每四個(gè)月在不同的營(yíng)地之間移動(dòng)一次。他們主要飲用泉水和溪水，飲食包括覓食的塊莖、漿果、蜂蜜和狩獵的動(dòng)物。

對(duì)從167個(gè)哈扎族人收集的糞便樣本進(jìn)行了宏基因組測(cè)序。在哈扎族人腸道微生物中發(fā)現(xiàn)的840萬(wàn)個(gè)蛋白家族中，有一半以上（59.7%）在統(tǒng)一的人類胃腸道蛋白數(shù)據(jù)庫(kù)（Unified Human Gastrointestinal Protein database）中沒(méi)有。在他們的腸道微生物組中發(fā)現(xiàn)的細(xì)菌和病毒種類使全球已知的微生物群目錄增加了約24%。

為了進(jìn)行局部比較，這些作者將他們的研究結(jié)果與成年的加利福尼亞人進(jìn)行了比較，發(fā)現(xiàn)雖然哈扎族人的成年腸道微生物組平均包含730個(gè)物種，但加利福尼亞人的腸道微生物組中只有277個(gè)物種。

這些作者指出，“一個(gè)重要的挑戰(zhàn)是描述這些微生物對(duì)人類生理的影響，并確定在哪些情況下，物種和功能的缺失或存在對(duì)人類健康有益或有害?！?/p>

了解缺乏多樣性對(duì)西方代謝的影響，或者哈扎族人通過(guò)擁有這種強(qiáng)大的多樣性而避免了哪些疾病（如果有的話），將是非常有吸引力的。工業(yè)化人群中消失的微生物群不太可能是沒(méi)有原因的，盡管可能只是因?yàn)檫@些原因不再適用。

得益于這項(xiàng)新的研究，未來(lái)的研究人員有許多新的謎團(tuán)需要解決，并且如今有一個(gè)超深的宏基因組測(cè)序數(shù)據(jù)集來(lái)指導(dǎo)他們提出的問(wèn)題。（生物谷 Bioon.com）

參考資料：

1. Matthew M. Carter et al. Ultra-deep sequencing of Hadza hunter-gatherers recovers vanishing gut microbes. Cell, 2023, doi:10.1016/j.cell.2023.05.046.

2. Striking level of genomic novelty found in Hadza hunter-gatherer microbiomehttps://medicalxpress.com/news/2023-06-genomic-novelty-hadza-hunter-gatherer-microbiome.html